Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre

Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre

El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente poblaciones silvestres y cultivadas de P. magdalenae usando marcadores moleculares tipo RAMs en la zona del bajo San Jorge, Departamento de Sucre. Para ello, de 80 ejemplares silvestres de cuatro sitios y 40 ejemplares cultivados de dos empresas, fue extraído el ADN y amplificado por PCR con siete cebadores RAMs. Todos los cebadores fueron polimórficos, con valores que variaron de 93,33% en el cebador CA hasta 99,17% en AG, este mismo cebador presentó el mayor valor de He (0,469 ± 0,005), mientras que el cebador CCA, presentó el menor (0,321 ± 0,010). En las poblaciones silvestres de P. magdalenae, el sitio SBA fue el más diverso (He: 0,194 ± 0,028) y el sitio CAI el menos dive... Ver más

Guardado en:

Revista Colombiana de Ciencia Animal - RECIA

2027-4297

Hernández H,, Darwin

Navarro M, Orlando

Muñoz F, Jaime

UNIVERSIDAD DE SUCRE

10.24188/recia.v9.nS.2017.527

9

2017-05-05

99

106

Colombia

Microsatélites amplificados al azar

Recursos genéticos

Peces endémicos.

info:eu-repo/semantics/openAccess

http://purl.org/coar/access_right/c_abf2

id c17fa37ba7e7f96bab359eb8b53be763
record_format ojs
spelling Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
ORTEGA, A.; MURILLO, O.; PIMIENTA, M.; STERLING, J. 2000. Peces dela cuenca alta del Río Cauca. Riqueza ictiológica del Valle Cauca.Corporación Autónoma Regional del Valle del Cauca, CVC. 68 pp.
CAETANO, 2013. Caracterización genética y ambiental del Dorado (CoryphaenahippurusL.) en el pacífico Colombiano. Tesis Doctoral. Universidad Nacional de Colombia.
CASTAÑEDA, D. 2012. Evaluación de la calidad genética de sistemas de reproductores de bocachico Prochilodusmagdalenae(pisces: prochilodontidae) usados para repoblamiento en dos estaciones piscícolas. Tesis de Grado Universidad del Magdalena.
EXCOFFIER, L.; LISCHER, H. 2010. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol EcolResour, 10: 564-567.
HERNÁNDEZ, D.; MUÑOZ, D.; VALENCIA, N.; POSSO, A.; MUÑOZ, J. 2007. Caracterización molecular del pato criollo colombiano en cuatro departamentos. Acta Agronómica, 56(3): 141-145.
MANCERA-RODRIGUEZ, N.; MARQUEZ, J.; HURTADO-ALARCON, J. 2013. Uso de citogenéticay técnicas moleculares enestudios de diversidad genéticaen peces colombianos. En: Uso de Biología Molecular en Producción Animal y Conservación de Especies Silvestres. Centro De Publicaciones De La Universidad Nacional De Colombia Sede Medellín. 237-312p.
MUÑOZ, J.; MORILLO, A.; MORILLO, Y. 2008. Microsatelites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal. Acta Agronómica, 57(4): 219-226.
MUÑOZ, L.E. 2013. Establecimiento de dos lotes de reproductores de bocachico Prochilodusmagdalenae (characiformes, prochilodontidae) utilizando criterios genéticos para obtener progenies con fines de repoblamiento. Tesis de grado Universidad del Magdalena.
MOJICA, J.; USAMA, J.; ÁLVAREZ, R.; LASSO, C. 2012. Libro rojo de peces dulceacuícolas de Colombia 2012. Instituto de Investigación de Recursos Bioló- gicos Alexander von Humboldt, Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia, WWF Colombia y Universidad de Manizales. Bogotá, D. C., Colombia, 319 pp.
LEUNG, H.; NELSON, R. H.; LEACH, J. E. 1993.Population structure of plant pathogenic fungi and bacteria. AdvPlantPathol, 10:157-205.
LÓPEZ-MACIAS, J. N.; GARCIA-VALLEJO, F.; RÚBIO-RINCÓN, E.; CASTILLO-GIRALDO, A.; CERÓN, F. 2009. Diversidad genética del bocachico (Prochilodusreticulatus) de la cuenca alta del Río Cauca (Colombia). Acta Biológica Paranaense, 38(3-4): 113-138.
MORA, S. R. 2010. Análisis espacial y patrones de asentamiento en el bajo río San Jorge (Caribe colombiano).Boletín de Antropología Universidad de Antioquia, 24(41): 283-305.
NARVÁEZ, J.; AGUIRRE, J.; OROZCO, G.; CASTAÑEDA, D.; MUÑOS, E.; JULIO, Y.; TORREGROZA, A. 2012. Primer programa de genética de la conservación para peces en Colombia. CONAMA (Congreso Nacional Del Medio Ambiente), 1-17.http://www.conama2012.conama.org/web/generico.php?idpaginas=&lang=es&menu=90&referer=1&id=13&tipo=C&op=view&from=viewpersonas
OROZCO, B.; NARVÁEZ, J. 2014.Genetic diversity and population structure of bocachico Prochilodusmagdalenae (Pisces, Prochilodontidae) in the Magdalena River basin and its tributaries, Colombia. Genetics and Molecular Biology, 37(1): 37-45
OSLINGER, A.; MUÑOZ, J.; ALVARE, L.; MORENO, F.; POSSO, A. 2006. Caracterización de cerdos criollos colombianos mediante la técnica molecular RAMs. ActaAgronómica, 55(4): 45-50.
ARRIETA, J. 2013. Evaluación de la variabilidad y estructura genética de la población silvestre y cultivada de bocachico Prochilodusmagdalenae(characiformes: prochilodontidae) en la cuenca del río Sinú y en dos estaciones piscícolas del departamento de Córdoba-Colombia. Tesis de grado. Universidad del Magdalena.
PEAKALL, R.; SMOUSE, P. 2012. GENALEX 6.5: genetic analysis in Excel.Population genetic software for teaching and research-an update.Bioinformatics, 28: 2537-2539.
PIEDRAHÍTA, A.M. 2003. Caracterización molecular del Ganado criollo colombiano Hartón del Valle mediante marcadores moleculares tipo RAM`s. Tesis de grado. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. 103p.
USTATE, D. 2002. Estudio de prospectiva de la cadena productiva de la industria pesquera en la República de Colombia. Unido. Project No: US/ RLA/02/149. Ministerio de Comercio Industria y Turismo. 49 pp.http://www.unido.org/fileadmin/import/38129EstudiodeProspectivadeColombia.pdf
SANTACRUZ, D.H. 2003. Evaluación de la variabilidad genética conmarcadoresmicrosatelites del bocachico Prochilodusmagdalenae(Steindachner 1878) en el Río Sinú, Colombia. Tesis de Grado, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá. 126 p.
TAMURA, K.; STECHER, G.; PETERSON, D.; FILIPSKI, A.; KUMAR, S. 2013. MEGA6: Molecular EvolutionaryGeneticsAnalysisVersion 6.0. Mol BiolEvol, 30: 2725-2729.
info:eu-repo/semantics/article
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
http://purl.org/redcol/resource_type/ARTREF
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
info:eu-repo/semantics/openAccess
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
Text
CAETANO, B.; GUZMAN, A.; SELVARAJ, J.; POSSO, A.; MUÑOZ, J.; ORDOÑEZ, M. 2012. Caracterización molecular del pez dorado (Coryphaenahippurus) en elPacífico colombiano utilizando marcadores moleculares RAMs. Acta Agronómica, Número especial - 2012.
AGUIRRE-PABÓN, J.; NARVÁEZ, J.;CASTRO, L. 2013. Mitochondrial DNA variation of the bocachico Prochilodusmagdalenae(Characiformes, Prochilodontidae) in the Magdalena River Basin, Colombia.AquaticConservation Marine andFreshwaterEcosyst, 23(4): 594-605
Publication
Núm. S1 , Año 2017 : RECIA 9(SUPL1):MAYO
El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente poblaciones silvestres y cultivadas de P. magdalenae usando marcadores moleculares tipo RAMs en la zona del bajo San Jorge, Departamento de Sucre. Para ello, de 80 ejemplares silvestres de cuatro sitios y 40 ejemplares cultivados de dos empresas, fue extraído el ADN y amplificado por PCR con siete cebadores RAMs. Todos los cebadores fueron polimórficos, con valores que variaron de 93,33% en el cebador CA hasta 99,17% en AG, este mismo cebador presentó el mayor valor de He (0,469 ± 0,005), mientras que el cebador CCA, presentó el menor (0,321 ± 0,010). En las poblaciones silvestres de P. magdalenae, el sitio SBA fue el más diverso (He: 0,194 ± 0,028) y el sitio CAI el menos diverso (0,150 ± 0,029), para un promedio de He de 0,167 ± 0,019 que fue menor al promedio de la población cultivada (He: 0,194 ± 0,002). El análisis de la estructura poblacional reflejo mayor variación dentro que entre de las poblaciones con valores de FST moderados y altos, indicando bajo flujo de genes entre sitios y entre las poblaciones silvestres y cultivadas que se evidencia en los dendrogramas. Se concluye que esta estructura genética puede ser debida a barreras fisiográficas naturales o artificiales y que la mayor diversidad en la población cultivada puede deberse a un adecuado manejo reproductivo o efectos de endogamia en la población silvestre.
Hernández H,, Darwin
Navarro M, Orlando
Muñoz F, Jaime
Microsatélites amplificados al azar
Recursos genéticos
Peces endémicos.
9
S1
Artículo de revista
Universidad de Sucre
application/pdf
Revista Colombiana de Ciencia Animal - RECIA
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/view/527
Español
Genetic diversity of bocachico Prochilodus magdalenae in the department of Sucre
Endemic fish
Journal article
Therefore the objective of the present study was to characterize genetically wild and cultivated populations of P. magdalenae, using molecular markers type RAMs in the area of the lower San Jorge, in the Department of Sucre. For this, DNA was extracted and PCR amplified with seven primers RAMs, in a sample of 80 wild specimens from four sites and 40 cultured specimens from two companies the. All primers RAMs were polymorphic with values ranging from 93,33% in the CA primer to 99,17% in AG, this primer had the highest He value (0,469 ± 0,005), while the CCA primer had the lowest value (0,321 ± 0,010). In the wild populations of P. magdalenae the SBA site was the most diverse (He: 0,194 ± 0,028) and the CAI site was the least diverse (0,150 ± 0,029), with an He average of 0,167 ± 0,019, that was lower than the average often cultivated population (He: 0,194 ± 0,002). The analysis of the population structure reflects greater variation within that between the populations with moderate and high FST values, indicating low gene flow between sites and between wild and cultivated populations, that is evidenced in dendrograms. It is concluded that this genetic structure can be due to natural or artificial physiographic barriers and that the greater diversity in the cultivated population can be due to an adequate reproductive management or endogamy effects in the wild population.
Random amplified microsatellites.
Genetic resources
99
https://doi.org/10.24188/recia.v9.nS.2017.527
2017-05-05
https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/download/527/pdf
2017-05-05T00:00:00Z
2027-4297
106
2017-05-05T00:00:00Z
10.24188/recia.v9.nS.2017.527
institution UNIVERSIDAD DE SUCRE
thumbnail https://nuevo.metarevistas.org/UNIVERSIDADDESUCRE/logo.png
country_str Colombia
collection Revista Colombiana de Ciencia Animal - RECIA
title Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
spellingShingle Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
Hernández H,, Darwin
Navarro M, Orlando
Muñoz F, Jaime
Microsatélites amplificados al azar
Recursos genéticos
Peces endémicos.
Endemic fish
Random amplified microsatellites.
Genetic resources
title_short Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
title_full Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
title_fullStr Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
title_full_unstemmed Diversidad genética del bocachico Prochilodus magdalenae en el departamento de Sucre
title_sort diversidad genética del bocachico prochilodus magdalenae en el departamento de sucre
title_eng Genetic diversity of bocachico Prochilodus magdalenae in the department of Sucre
description El objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente poblaciones silvestres y cultivadas de P. magdalenae usando marcadores moleculares tipo RAMs en la zona del bajo San Jorge, Departamento de Sucre. Para ello, de 80 ejemplares silvestres de cuatro sitios y 40 ejemplares cultivados de dos empresas, fue extraído el ADN y amplificado por PCR con siete cebadores RAMs. Todos los cebadores fueron polimórficos, con valores que variaron de 93,33% en el cebador CA hasta 99,17% en AG, este mismo cebador presentó el mayor valor de He (0,469 ± 0,005), mientras que el cebador CCA, presentó el menor (0,321 ± 0,010). En las poblaciones silvestres de P. magdalenae, el sitio SBA fue el más diverso (He: 0,194 ± 0,028) y el sitio CAI el menos diverso (0,150 ± 0,029), para un promedio de He de 0,167 ± 0,019 que fue menor al promedio de la población cultivada (He: 0,194 ± 0,002). El análisis de la estructura poblacional reflejo mayor variación dentro que entre de las poblaciones con valores de FST moderados y altos, indicando bajo flujo de genes entre sitios y entre las poblaciones silvestres y cultivadas que se evidencia en los dendrogramas. Se concluye que esta estructura genética puede ser debida a barreras fisiográficas naturales o artificiales y que la mayor diversidad en la población cultivada puede deberse a un adecuado manejo reproductivo o efectos de endogamia en la población silvestre.
description_eng Therefore the objective of the present study was to characterize genetically wild and cultivated populations of P. magdalenae, using molecular markers type RAMs in the area of the lower San Jorge, in the Department of Sucre. For this, DNA was extracted and PCR amplified with seven primers RAMs, in a sample of 80 wild specimens from four sites and 40 cultured specimens from two companies the. All primers RAMs were polymorphic with values ranging from 93,33% in the CA primer to 99,17% in AG, this primer had the highest He value (0,469 ± 0,005), while the CCA primer had the lowest value (0,321 ± 0,010). In the wild populations of P. magdalenae the SBA site was the most diverse (He: 0,194 ± 0,028) and the CAI site was the least diverse (0,150 ± 0,029), with an He average of 0,167 ± 0,019, that was lower than the average often cultivated population (He: 0,194 ± 0,002). The analysis of the population structure reflects greater variation within that between the populations with moderate and high FST values, indicating low gene flow between sites and between wild and cultivated populations, that is evidenced in dendrograms. It is concluded that this genetic structure can be due to natural or artificial physiographic barriers and that the greater diversity in the cultivated population can be due to an adequate reproductive management or endogamy effects in the wild population.
author Hernández H,, Darwin
Navarro M, Orlando
Muñoz F, Jaime
author_facet Hernández H,, Darwin
Navarro M, Orlando
Muñoz F, Jaime
topicspa_str_mv Microsatélites amplificados al azar
Recursos genéticos
Peces endémicos.
topic Microsatélites amplificados al azar
Recursos genéticos
Peces endémicos.
Endemic fish
Random amplified microsatellites.
Genetic resources
topic_facet Microsatélites amplificados al azar
Recursos genéticos
Peces endémicos.
Endemic fish
Random amplified microsatellites.
Genetic resources
citationvolume 9
citationissue S1
citationedition Núm. S1 , Año 2017 : RECIA 9(SUPL1):MAYO
publisher Universidad de Sucre
ispartofjournal Revista Colombiana de Ciencia Animal - RECIA
source https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/view/527
language Español
format Article
rights info:eu-repo/semantics/openAccess
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
references ORTEGA, A.; MURILLO, O.; PIMIENTA, M.; STERLING, J. 2000. Peces dela cuenca alta del Río Cauca. Riqueza ictiológica del Valle Cauca.Corporación Autónoma Regional del Valle del Cauca, CVC. 68 pp.
CAETANO, 2013. Caracterización genética y ambiental del Dorado (CoryphaenahippurusL.) en el pacífico Colombiano. Tesis Doctoral. Universidad Nacional de Colombia.
CASTAÑEDA, D. 2012. Evaluación de la calidad genética de sistemas de reproductores de bocachico Prochilodusmagdalenae(pisces: prochilodontidae) usados para repoblamiento en dos estaciones piscícolas. Tesis de Grado Universidad del Magdalena.
EXCOFFIER, L.; LISCHER, H. 2010. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol EcolResour, 10: 564-567.
HERNÁNDEZ, D.; MUÑOZ, D.; VALENCIA, N.; POSSO, A.; MUÑOZ, J. 2007. Caracterización molecular del pato criollo colombiano en cuatro departamentos. Acta Agronómica, 56(3): 141-145.
MANCERA-RODRIGUEZ, N.; MARQUEZ, J.; HURTADO-ALARCON, J. 2013. Uso de citogenéticay técnicas moleculares enestudios de diversidad genéticaen peces colombianos. En: Uso de Biología Molecular en Producción Animal y Conservación de Especies Silvestres. Centro De Publicaciones De La Universidad Nacional De Colombia Sede Medellín. 237-312p.
MUÑOZ, J.; MORILLO, A.; MORILLO, Y. 2008. Microsatelites amplificados al azar (RAM) en estudios de diversidad genética vegetal. Acta Agronómica, 57(4): 219-226.
MUÑOZ, L.E. 2013. Establecimiento de dos lotes de reproductores de bocachico Prochilodusmagdalenae (characiformes, prochilodontidae) utilizando criterios genéticos para obtener progenies con fines de repoblamiento. Tesis de grado Universidad del Magdalena.
MOJICA, J.; USAMA, J.; ÁLVAREZ, R.; LASSO, C. 2012. Libro rojo de peces dulceacuícolas de Colombia 2012. Instituto de Investigación de Recursos Bioló- gicos Alexander von Humboldt, Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia, WWF Colombia y Universidad de Manizales. Bogotá, D. C., Colombia, 319 pp.
LEUNG, H.; NELSON, R. H.; LEACH, J. E. 1993.Population structure of plant pathogenic fungi and bacteria. AdvPlantPathol, 10:157-205.
LÓPEZ-MACIAS, J. N.; GARCIA-VALLEJO, F.; RÚBIO-RINCÓN, E.; CASTILLO-GIRALDO, A.; CERÓN, F. 2009. Diversidad genética del bocachico (Prochilodusreticulatus) de la cuenca alta del Río Cauca (Colombia). Acta Biológica Paranaense, 38(3-4): 113-138.
MORA, S. R. 2010. Análisis espacial y patrones de asentamiento en el bajo río San Jorge (Caribe colombiano).Boletín de Antropología Universidad de Antioquia, 24(41): 283-305.
NARVÁEZ, J.; AGUIRRE, J.; OROZCO, G.; CASTAÑEDA, D.; MUÑOS, E.; JULIO, Y.; TORREGROZA, A. 2012. Primer programa de genética de la conservación para peces en Colombia. CONAMA (Congreso Nacional Del Medio Ambiente), 1-17.http://www.conama2012.conama.org/web/generico.php?idpaginas=&lang=es&menu=90&referer=1&id=13&tipo=C&op=view&from=viewpersonas
OROZCO, B.; NARVÁEZ, J. 2014.Genetic diversity and population structure of bocachico Prochilodusmagdalenae (Pisces, Prochilodontidae) in the Magdalena River basin and its tributaries, Colombia. Genetics and Molecular Biology, 37(1): 37-45
OSLINGER, A.; MUÑOZ, J.; ALVARE, L.; MORENO, F.; POSSO, A. 2006. Caracterización de cerdos criollos colombianos mediante la técnica molecular RAMs. ActaAgronómica, 55(4): 45-50.
ARRIETA, J. 2013. Evaluación de la variabilidad y estructura genética de la población silvestre y cultivada de bocachico Prochilodusmagdalenae(characiformes: prochilodontidae) en la cuenca del río Sinú y en dos estaciones piscícolas del departamento de Córdoba-Colombia. Tesis de grado. Universidad del Magdalena.
PEAKALL, R.; SMOUSE, P. 2012. GENALEX 6.5: genetic analysis in Excel.Population genetic software for teaching and research-an update.Bioinformatics, 28: 2537-2539.
PIEDRAHÍTA, A.M. 2003. Caracterización molecular del Ganado criollo colombiano Hartón del Valle mediante marcadores moleculares tipo RAM`s. Tesis de grado. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira. 103p.
USTATE, D. 2002. Estudio de prospectiva de la cadena productiva de la industria pesquera en la República de Colombia. Unido. Project No: US/ RLA/02/149. Ministerio de Comercio Industria y Turismo. 49 pp.http://www.unido.org/fileadmin/import/38129EstudiodeProspectivadeColombia.pdf
SANTACRUZ, D.H. 2003. Evaluación de la variabilidad genética conmarcadoresmicrosatelites del bocachico Prochilodusmagdalenae(Steindachner 1878) en el Río Sinú, Colombia. Tesis de Grado, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá. 126 p.
TAMURA, K.; STECHER, G.; PETERSON, D.; FILIPSKI, A.; KUMAR, S. 2013. MEGA6: Molecular EvolutionaryGeneticsAnalysisVersion 6.0. Mol BiolEvol, 30: 2725-2729.
CAETANO, B.; GUZMAN, A.; SELVARAJ, J.; POSSO, A.; MUÑOZ, J.; ORDOÑEZ, M. 2012. Caracterización molecular del pez dorado (Coryphaenahippurus) en elPacífico colombiano utilizando marcadores moleculares RAMs. Acta Agronómica, Número especial - 2012.
AGUIRRE-PABÓN, J.; NARVÁEZ, J.;CASTRO, L. 2013. Mitochondrial DNA variation of the bocachico Prochilodusmagdalenae(Characiformes, Prochilodontidae) in the Magdalena River Basin, Colombia.AquaticConservation Marine andFreshwaterEcosyst, 23(4): 594-605
type_driver info:eu-repo/semantics/article
type_coar http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
type_version info:eu-repo/semantics/publishedVersion
type_coarversion http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
type_content Text
publishDate 2017-05-05
date_accessioned 2017-05-05T00:00:00Z
date_available 2017-05-05T00:00:00Z
url https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/view/527
url_doi https://doi.org/10.24188/recia.v9.nS.2017.527
eissn 2027-4297
doi 10.24188/recia.v9.nS.2017.527
citationstartpage 99
citationendpage 106
url2_str_mv https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/download/527/pdf
_version_ 1797159569904893952

Código QR

Estadísticas y Métricas Alternativas

Títulos similares