Bacterias heterotrofas y oligotróficas en zonas conservadas e intervenidas del páramo de La Cortadera, Boyacá, Colombia
Los páramos brindan servicios ambientales fundamentales a la población, por la continua provisión de agua, en cantidad y en calidad y el almacenamiento de carbono atmosférico, que ayuda a regular el calentamiento global. Estos ecosistemas están sufriendo irreparables transformaciones, que controlan directa o indirectamente la estructura de las comunidades de microorganismos, cuya actividad es esencial para el mantenimiento de los ciclos biogeoquímicos. Se evaluó la diversidad de bacterias heterótrofas y oligotróficas, en los horizontes A, AB y B, de zonas conservadas y de zonas intervenidas en el Páramo de la Cortadera, en tres áreas de muestreo, ubicadas en los municipios de Siachoque, Pesca y Toca. El número de bacterias heterótrofas aeró... Ver más
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Bacterias heterotrofas y oligotróficas en zonas conservadas e intervenidas del páramo de La Cortadera, Boyacá, Colombia FLÓREZ-ZAPATA, N.; URIBE-VÉLEZ, D. 2011. Biological and physicochemical parameters related to the nitrogen cycle in the Rhizospheric soil of native potato (Solanum phureja) crops of Colombia. Appl. Environm. Soil Sci. Article ID 847940, 10p. LIZARAZO-MEDINA, P.; GÓMEZ-VÁSQUEZ, D. 2015. Microbiota rizosférica de Espeletia spp. de los Páramos de Santa Inés y de Frontino-Urrao en Antioquia, Colombia. Acta Biol. Col. 20(1):175-182. LAUBER, C.; HAMADY, M.; KNIGHT, R.; FIERER, N. 2009. Pyrosequencing-based assessment of soil pH as a predictor of soil bacterial community structure at the continental scale. Appl. Environ. Microbiol. 75(15):5111-5120. KOSTKA, J.; PRAKASH, O.; OVERHOLT, W.; GREEN, S.; FREYER, G.; CANION, A.; DELGARDIO, J.; NORTON, N.; HAZEN, T.; HUETTEL, M. 2011. Hydrocarbon-degrading bacteria and the bacterial community response in gulf of Mexico beach sands impacted by the deepwater horizon oil spill. Appl. Environ. Microbiol. 77(22):7962-7974. JUNG, J.; PARK, W. 2015. Acinetobacter species as model microorganisms in environmental microbiology: current state and perspectives. Appl. Microbiol. Biotechnol. 99(6):2533-2548. INSTITUTO GEOGRÁFICO AGUSTÍN CODAZZI. 2005. Estudio general de suelos y zonificación de tierras del departamento de Boyacá. Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia. Tunja, Boyacá. 158p. HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, A.; CABALLERO, A.; PAZOS, M.; RAMÍREZ, R.; HEYDRICH, M. 2003. Identificación de algunos géneros microbianos asociados al cultivo del maíz (Zea mays L.) en diferentes suelos de Cuba. Rev. Col. Biotecn. 5(1):45-55. HASHIMOTO, T.; WHANG, S.K.; NAGAOKA, T. 2006. A quantitative evaluation and phylogenetic characterization of oligotrophic denitrifying bacteria harbored in subsurface upland soil using improved culturability. Biol. Fertil. Soils. 42:179-185. FIGUEROA DEL CASTILLO, L.; MELGAREJO, M.; FUENTES DE PIEDRAHÍTA, C.; LOZANO DE YUNDA, A. 2010. Mineralización de 14C-glifosato y seguimiento de la dinámica de las poblaciones de Pseudomonas sp. en tres suelos del departamento del Tolima (Colombia) sometidos a diferente uso. Agron. Col. 28(3):413-420. MORALES, M.; OTERO, J.; VAN DER HAMMEN, T.; TORRES, A.; CADENA, C.; PEDRAZA, C. 2007. Atlas de páramos de Colombia. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt. 208p. FIGUEIREDO, N.; CARRANCA, C.; GOUFO, P.; PEREIRA, J.; TRINDADE, H.; COUTINHO, J. 2015. Impact of agricultural practices, elevated temperature and atmospheric carbon dioxide concentration on nitrogen and pH dynamics in soil and floodwater during the seasonal rice growth in Portugal. Soil Tillage Res. 145:198-207. FALKOWSKI, P.; FENCHEL, T.; DELONG, E. 2008. The microbial engines that drive Earth's biogeochemical cycles. Science. 320:1034-1039. ESTUPIÑÁN, L.; GÓMEZ, J.; BARRANTES, V.; LIMAS, L. 2009. Efecto de actividades agropecuarias en las características del suelo en el páramo el Granizo (Cundinamarca - Colombia). Rev. U.D.C.A Act. & Div. Cient. 12(2):79-89. EILERS, K.; DEBENPORT, S.; ANDERSON, S.; FIERER, N. 2012. Digging deeper to find unique microbial communities: The strong effect of depth on the structure of bacterial and archaeal communities in soil. Soil Biol. Biochem. 50:58-65. DRENOVSKY, R.; VO, D.; GRAHAM, K.; SCOW, K. 2004. Soil water content and organic carbon availability are major determinants of soil microbial community composition. Micro. Ecol. 48:424-430. DAZA-TORRES, M.; HERNÁNDEZ-FLOREZ, F.; TRIANA, F. 2014. Efecto del uso del suelo en la capacidad de almacenamiento hídrico en el Páramo de Sumapaz Colombia. Rev. Fac. Nal. Agr. Medellin. 67(1):7189-7200. CHO, J.; GIOVANNONI, S. 2004. Cultivation and growth characteristics of a diverse group of oligotrophic marine Gammaproteobacteria. Appl. Environ. Microbiol. 70:432-440. LYNGWI, N.; KOIJAM, K.; SHARMA, D.; JOSHI, R. 2013. Cultivable bacterial diversity along the altitudinal zonation and vegetation range of tropical Eastern Himalaya. Rev. Biol. Trop. 61(1):467-490. MORATTO, C.; MARTÍNEZ, L.; VALENCIA, H.; SÁNCHEZ, J. 2005. Efecto del uso del suelo sobre hongos solubilizadores de fosfato y bacterias diazotróficas en el páramo de Guerrero (Cundinamarca). Agr. Col. 23(2):299-309. BUSS, H.; BRUNS, M.; SCHULTZ, M.; MOORE, J.; MATHUR, C.; BRANTLEY, S. 2005. The coupling of biological iron cycling and mineral weathering during saprolite formation, Luquillo Mountains, Puerto Rico. 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SICILIANO, S.; PALMER, A.; WINSLEY, T.; LAMB, E.; BISSETT, A.; BROWN, M.; DORST, J.; JI, M.; FERRARI, B.; GROGAN, P.; CHU, H.; SNAPE, I. 2014. Soil fertility is associated with fungal and bacterial richness, whereas pH is associated with community composition in polar soil microbial communities. Soil Biol. Biochem. 78:10-20. SAITO, A.; MITSUI, H.; HATTORI, R.; MINAMISAWA, K.; HATTORI, T. 1998. Slow-growing and oligotrophic soil bacteria philogenetically close to Bradyrhizobium japonicum. Microbiol. Ecol. 25(3):277-286. ROUSK, J.; BAATH, E.; BROOKES, P.; LAUBER, C.; LOZUPONE, C.; CAPORASO, G.; KNIGHT, R.; FIERER, N. 2010. Soil bacterial and fungal communities across a pH gradient in an arable soil. The ISME J. 4:1340-1351. RIVERA, D.; RODRÍGUEZ, C. 2011. Guía divulgativa de criterios para la delimitación de páramos de Colombia. Instituto Humboldt. 68p. RENGEL, Z.; MARSCHNER, P. 2005. Nutrient availability and management in the Rhizosphere: exploiting genotypic differences. New Phytol. 168:305-312. RAMOS, E.; ZÚÑIGA, D. 2008. Efecto de la humedad, temperatura y pH del suelo en la actividad microbiana a nivel de laboratorio. Ecol. Apli. 7(1-2):123-130. PHUNG, N.; LEE, J.; HYUN, K.; CHANG, I.; GADD, G.; HONG, B. 2004. Analysis of microbial diversity in oligotrophic microbial fuel cells using 16 S rDNA sequences. Microbiol. Letters. 233:77-82. CHAKRABORTY, B.; CHAKRABORTY, U.; SHA, A.; SUNAR, K.; DEY, P. 2010. Evaluation of phosphate solubilizers from soils of North Bengal and their diversity analysis. World J. Agr. Sci. 6(2):195-200. CAÑÓN-CORTÁZAR, R.; AVELLANEDA-TORRES, L.; TORRES-ROJAS, E. 2012. Microorganismos asociados al ciclo del nitrógeno en suelos bajo tres sistemas de uso: cultivo de papa, ganadería y páramo, en el Parque Los Nevados, Colombia. Acta Agr. 61(4):371-379. BRENNER, D.; KRIEG, N.; JAMES, T. 2005. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume 2: The Proteobacteria (Part C). 2 Ed. Springer. ISBN-10:0-387-24145-0. ISBN-13: 978-0387-24145-6. text/html Los páramos brindan servicios ambientales fundamentales a la población, por la continua provisión de agua, en cantidad y en calidad y el almacenamiento de carbono atmosférico, que ayuda a regular el calentamiento global. Estos ecosistemas están sufriendo irreparables transformaciones, que controlan directa o indirectamente la estructura de las comunidades de microorganismos, cuya actividad es esencial para el mantenimiento de los ciclos biogeoquímicos. Se evaluó la diversidad de bacterias heterótrofas y oligotróficas, en los horizontes A, AB y B, de zonas conservadas y de zonas intervenidas en el Páramo de la Cortadera, en tres áreas de muestreo, ubicadas en los municipios de Siachoque, Pesca y Toca. El número de bacterias heterótrofas aeróbicas totales y bacterias oligotróficas, se estimaron como unidades formadoras de colonias, sembrándose en Agar TSA + Nistatina y Agar MSC-MSH, a 30°C, por 48 horas. Los suelos tienen una textura franco arcilloso, con pH ácido, bajo contenido de materia orgánica y altos niveles de P, aislándose los géneros Pseudomonas, Acinetobacter, Lactobacillus, Bacillus y Klebsiella, y bacterias oligotróficas de los géneros Caulobacter y Hyphomicrobium, siendo Pesca la zona más diversa del Páramo de La Cortadera. Dicha diversidad podría estar influenciada por una amplia gama de factores bióticos y abióticos, que se puede ver afectada por cambios ambientales o alteraciones antrópicas.   Ricardo Hernández, David Marina Lizarazo, Luz Diversidad cultivos antrópico horizontes suelos 18 2 Núm. 2 , Año 2015 :Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica. Julio-Diciembre Artículo de revista application/pdf Publication Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A BELTRÁN-PINEDA, M. 2014. Estudio comparativo de poblaciones microbianas totales y solubilizadoras de fosfato en suelos de páramo cultivados con papa (Solanumtuberosum) en Ventaquemada-Boyacá. I3+ Investigación, Innovación, Ingeniería. 2:56-74. BELTRÁN-PINEDA, M.; LIZARAZO-FORERO, L.M. 2013. Grupos funcionales de microorganismos en suelos de páramo perturbados por incendios forestales. Rev. Ciencias. 17(2):121-136. BAUMANN, P. 1968. Isolation of Acinetobacter from Soil and Water.Journal of Bacteriology. 96(1):39-42. https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Español https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/178 Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica anthropic The "paramo" provides essential environmental services to the population, being an ecological unit that regulates the water flows, and atmospheric carbon storage, which helps to control global warming. These ecosystems are suffering irreparable transformations that directly or indirectly control the structure of communities of microorganisms, which activity is essential for the maintenance of biogeochemical cycles. The diversity of heterotrophic and oligotrophic bacteria in horizons A, AB and B, of areas conserved and altered in the Páramo of Cortadera in the municipalities of Siachoque, Pesca and Toca were evaluated. The total number of aerobic heterotrophic and oligotrophic bacteria was estimated as colony forming units, being cultivated on Agar + Nystatin TSA Trypticase Soya Agar Scharlau®and Agar Agar MSC and MSH at 30°C for 48 hours respectively. The soils have a loamy clay texture, acid pH, low organic matter and high levels of P, isolating the genera Pseudomonas, Acinetobacter, Lactobacillus, Bacillus and Klebsiella, and oligotrophic bacteria genera Caulobacter, and Hyphomicrobium, being the most diverse the area Pesca. This diversity could be influenced by a wide range of biotic and abiotic factors, which can be affected by environmental changes and anthropogenic disturbances. Diversity crops horizonts soils Heterotrophic and oligotrophic bacteria in preserved and intervened areas of the paramo the Cortadera, Boyacá, Colombia Journal article 10.31910/rudca.v18.n2.2015.178 https://doi.org/10.31910/rudca.v18.n2.2015.178 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/178/136 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/178/1290 2619-2551 0123-4226 475 483 2015-12-31T00:00:00Z 2015-12-31T00:00:00Z 2015-12-31 |
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Los páramos brindan servicios ambientales fundamentales a la población, por la continua provisión de agua, en cantidad y en calidad y el almacenamiento de carbono atmosférico, que ayuda a regular el calentamiento global. Estos ecosistemas están sufriendo irreparables transformaciones, que controlan directa o indirectamente la estructura de las comunidades de microorganismos, cuya actividad es esencial para el mantenimiento de los ciclos biogeoquímicos. Se evaluó la diversidad de bacterias heterótrofas y oligotróficas, en los horizontes A, AB y B, de zonas conservadas y de zonas intervenidas en el Páramo de la Cortadera, en tres áreas de muestreo, ubicadas en los municipios de Siachoque, Pesca y Toca. El número de bacterias heterótrofas aeróbicas totales y bacterias oligotróficas, se estimaron como unidades formadoras de colonias, sembrándose en Agar TSA + Nistatina y Agar MSC-MSH, a 30°C, por 48 horas. Los suelos tienen una textura franco arcilloso, con pH ácido, bajo contenido de materia orgánica y altos niveles de P, aislándose los géneros Pseudomonas, Acinetobacter, Lactobacillus, Bacillus y Klebsiella, y bacterias oligotróficas de los géneros Caulobacter y Hyphomicrobium, siendo Pesca la zona más diversa del Páramo de La Cortadera. Dicha diversidad podría estar influenciada por una amplia gama de factores bióticos y abióticos, que se puede ver afectada por cambios ambientales o alteraciones antrópicas.
 
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The "paramo" provides essential environmental services to the population, being an ecological unit that regulates the water flows, and atmospheric carbon storage, which helps to control global warming. These ecosystems are suffering irreparable transformations that directly or indirectly control the structure of communities of microorganisms, which activity is essential for the maintenance of biogeochemical cycles. The diversity of heterotrophic and oligotrophic bacteria in horizons A, AB and B, of areas conserved and altered in the Páramo of Cortadera in the municipalities of Siachoque, Pesca and Toca were evaluated. The total number of aerobic heterotrophic and oligotrophic bacteria was estimated as colony forming units, being cultivated on Agar + Nystatin TSA Trypticase Soya Agar Scharlau®and Agar Agar MSC and MSH at 30°C for 48 hours respectively. The soils have a loamy clay texture, acid pH, low organic matter and high levels of P, isolating the genera Pseudomonas, Acinetobacter, Lactobacillus, Bacillus and Klebsiella, and oligotrophic bacteria genera Caulobacter, and Hyphomicrobium, being the most diverse the area Pesca. This diversity could be influenced by a wide range of biotic and abiotic factors, which can be affected by environmental changes and anthropogenic disturbances.
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Acinetobacter species as model microorganisms in environmental microbiology: current state and perspectives. Appl. Microbiol. Biotechnol. 99(6):2533-2548. INSTITUTO GEOGRÁFICO AGUSTÍN CODAZZI. 2005. Estudio general de suelos y zonificación de tierras del departamento de Boyacá. Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia. Tunja, Boyacá. 158p. HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, A.; CABALLERO, A.; PAZOS, M.; RAMÍREZ, R.; HEYDRICH, M. 2003. Identificación de algunos géneros microbianos asociados al cultivo del maíz (Zea mays L.) en diferentes suelos de Cuba. Rev. Col. Biotecn. 5(1):45-55. HASHIMOTO, T.; WHANG, S.K.; NAGAOKA, T. 2006. A quantitative evaluation and phylogenetic characterization of oligotrophic denitrifying bacteria harbored in subsurface upland soil using improved culturability. Biol. Fertil. Soils. 42:179-185. FIGUEROA DEL CASTILLO, L.; MELGAREJO, M.; FUENTES DE PIEDRAHÍTA, C.; LOZANO DE YUNDA, A. 2010. Mineralización de 14C-glifosato y seguimiento de la dinámica de las poblaciones de Pseudomonas sp. en tres suelos del departamento del Tolima (Colombia) sometidos a diferente uso. Agron. Col. 28(3):413-420. MORALES, M.; OTERO, J.; VAN DER HAMMEN, T.; TORRES, A.; CADENA, C.; PEDRAZA, C. 2007. Atlas de páramos de Colombia. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt. 208p. FIGUEIREDO, N.; CARRANCA, C.; GOUFO, P.; PEREIRA, J.; TRINDADE, H.; COUTINHO, J. 2015. Impact of agricultural practices, elevated temperature and atmospheric carbon dioxide concentration on nitrogen and pH dynamics in soil and floodwater during the seasonal rice growth in Portugal. Soil Tillage Res. 145:198-207. FALKOWSKI, P.; FENCHEL, T.; DELONG, E. 2008. The microbial engines that drive Earth's biogeochemical cycles. Science. 320:1034-1039. ESTUPIÑÁN, L.; GÓMEZ, J.; BARRANTES, V.; LIMAS, L. 2009. Efecto de actividades agropecuarias en las características del suelo en el páramo el Granizo (Cundinamarca - Colombia). Rev. U.D.C.A Act. & Div. Cient. 12(2):79-89. EILERS, K.; DEBENPORT, S.; ANDERSON, S.; FIERER, N. 2012. Digging deeper to find unique microbial communities: The strong effect of depth on the structure of bacterial and archaeal communities in soil. Soil Biol. Biochem. 50:58-65. DRENOVSKY, R.; VO, D.; GRAHAM, K.; SCOW, K. 2004. Soil water content and organic carbon availability are major determinants of soil microbial community composition. Micro. Ecol. 48:424-430. DAZA-TORRES, M.; HERNÁNDEZ-FLOREZ, F.; TRIANA, F. 2014. Efecto del uso del suelo en la capacidad de almacenamiento hídrico en el Páramo de Sumapaz Colombia. Rev. Fac. Nal. Agr. Medellin. 67(1):7189-7200. CHO, J.; GIOVANNONI, S. 2004. Cultivation and growth characteristics of a diverse group of oligotrophic marine Gammaproteobacteria. Appl. Environ. Microbiol. 70:432-440. LYNGWI, N.; KOIJAM, K.; SHARMA, D.; JOSHI, R. 2013. Cultivable bacterial diversity along the altitudinal zonation and vegetation range of tropical Eastern Himalaya. Rev. Biol. Trop. 61(1):467-490. MORATTO, C.; MARTÍNEZ, L.; VALENCIA, H.; SÁNCHEZ, J. 2005. Efecto del uso del suelo sobre hongos solubilizadores de fosfato y bacterias diazotróficas en el páramo de Guerrero (Cundinamarca). Agr. Col. 23(2):299-309. BUSS, H.; BRUNS, M.; SCHULTZ, M.; MOORE, J.; MATHUR, C.; BRANTLEY, S. 2005. The coupling of biological iron cycling and mineral weathering during saprolite formation, Luquillo Mountains, Puerto Rico. Geobiology. 3:247-260. VALLEJO-QUINTERO, V. 2013. Importancia y utilidad de la evaluación de la calidad de suelos mediante el componente microbiano: experiencias en sistemas silvopastoriles. Colombia Forestal. 16(1):83-99. MULETA, D.; ASSEFA, F.; BöRJESSOON, E.; GRANHALL, U. 2013. Phosphate solubilisingrhizobacteria associated with Coffeaarabica L. in natural coffee forests of southwestern Ethiopia. J. Saudi Soc. Agr. Sci. 12:73-84. STURZ, A.; MATHESON, B.; ARSENAULT, W.; KIMPINSKI, J.; CHRISTIE, B. 2001. Weeds as a source of plant growth promoting rhizobacteria in agricultural soils. Can. J. Microbiol. 47(11):1013-1024. SICILIANO, S.; PALMER, A.; WINSLEY, T.; LAMB, E.; BISSETT, A.; BROWN, M.; DORST, J.; JI, M.; FERRARI, B.; GROGAN, P.; CHU, H.; SNAPE, I. 2014. Soil fertility is associated with fungal and bacterial richness, whereas pH is associated with community composition in polar soil microbial communities. Soil Biol. Biochem. 78:10-20. SAITO, A.; MITSUI, H.; HATTORI, R.; MINAMISAWA, K.; HATTORI, T. 1998. Slow-growing and oligotrophic soil bacteria philogenetically close to Bradyrhizobium japonicum. Microbiol. Ecol. 25(3):277-286. ROUSK, J.; BAATH, E.; BROOKES, P.; LAUBER, C.; LOZUPONE, C.; CAPORASO, G.; KNIGHT, R.; FIERER, N. 2010. Soil bacterial and fungal communities across a pH gradient in an arable soil. The ISME J. 4:1340-1351. RIVERA, D.; RODRÍGUEZ, C. 2011. Guía divulgativa de criterios para la delimitación de páramos de Colombia. Instituto Humboldt. 68p. RENGEL, Z.; MARSCHNER, P. 2005. Nutrient availability and management in the Rhizosphere: exploiting genotypic differences. New Phytol. 168:305-312. RAMOS, E.; ZÚÑIGA, D. 2008. Efecto de la humedad, temperatura y pH del suelo en la actividad microbiana a nivel de laboratorio. Ecol. Apli. 7(1-2):123-130. PHUNG, N.; LEE, J.; HYUN, K.; CHANG, I.; GADD, G.; HONG, B. 2004. Analysis of microbial diversity in oligotrophic microbial fuel cells using 16 S rDNA sequences. Microbiol. Letters. 233:77-82. CHAKRABORTY, B.; CHAKRABORTY, U.; SHA, A.; SUNAR, K.; DEY, P. 2010. Evaluation of phosphate solubilizers from soils of North Bengal and their diversity analysis. World J. Agr. Sci. 6(2):195-200. CAÑÓN-CORTÁZAR, R.; AVELLANEDA-TORRES, L.; TORRES-ROJAS, E. 2012. Microorganismos asociados al ciclo del nitrógeno en suelos bajo tres sistemas de uso: cultivo de papa, ganadería y páramo, en el Parque Los Nevados, Colombia. Acta Agr. 61(4):371-379. BRENNER, D.; KRIEG, N.; JAMES, T. 2005. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Volume 2: The Proteobacteria (Part C). 2 Ed. Springer. ISBN-10:0-387-24145-0. ISBN-13: 978-0387-24145-6. BELTRÁN-PINEDA, M. 2014. Estudio comparativo de poblaciones microbianas totales y solubilizadoras de fosfato en suelos de páramo cultivados con papa (Solanumtuberosum) en Ventaquemada-Boyacá. I3+ Investigación, Innovación, Ingeniería. 2:56-74. BELTRÁN-PINEDA, M.; LIZARAZO-FORERO, L.M. 2013. Grupos funcionales de microorganismos en suelos de páramo perturbados por incendios forestales. Rev. Ciencias. 17(2):121-136. BAUMANN, P. 1968. Isolation of Acinetobacter from Soil and Water.Journal of Bacteriology. 96(1):39-42. |
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2015-12-31 |
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2015-12-31T00:00:00Z |
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2015-12-31T00:00:00Z |
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0123-4226 |
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2619-2551 |
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